豊かな自然が残る伊豆沼・内沼ですが、近年、さまざまな環境問題も生じています。かつての伊豆沼・内沼は、透明度が高く、水底まで見ることができ、ジュンサイなどのきれいな水を好む動植物がすんでいました。しかし、周辺地域の開発や農地造成がすすむと、生活排水や農地からの濁水が流れ込むようになりました。沼の水は栄養分が多くなり、浮泥やプランクトンによる濁った沼に変わってしまいました。 　沼が浅くなる浅底化も大きな問題です。伊豆沼・内沼は、もともと長い時間をかけて少しずつ埋まってきた沼です。ところが、近年上流から流れ込む泥や沼の中で過剰に繁茂したハスが枯れて底に堆積することによって、沼が浅くなる速度が速くなっています。 　伊豆沼・内沼で最も大きな問題となっているのが、生物相の単純化です。多種多様な動植物がバランスを保って暮らしていたのが本来の伊豆沼・内沼の自然でした。しかし、近年、ハスが過剰に繁茂したり、外来生物のブラックバスが増加したり、マガンが集中的に分布するなど、ある種類が増えすぎることによって、自然のバランスが崩れてきています。 　伊豆沼財団では、地域の方々やボランティア、大学等の研究機関と協力しながら、本来のバランスのとれた伊豆沼・内沼の自然を取り戻すために、さまざまな保全活動に取り組んでいます。 　→　伊豆沼・内沼の環境問題について詳しい説明は こちら

伊豆沼・内沼では、水質悪化や生物相の単純化、外来生物の増加などの問題があり、昔の豊かな沼の自然を取り戻す必要性が生じたことから、平成21年度より伊豆沼・内沼自然再生事業（宮城県HP）が行われています。事業の内容は、水生植物の復元や魚貝類の増殖、流入負荷の低減、浅底化の防止などがあります。 　→　伊豆沼・内沼の自然再生事業の詳しい説明は こちら

→　伊豆沼・内沼よみがえれ在来生物プロジェクトの詳しい説明は こちら